Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn1P35821 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn1P35821 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms