Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nedd1P33215 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms