Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc11P31313 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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