Protein–RNA interactions for Protein: P30873

Sstr1, Somatostatin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr1P30873 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sstr1P30873 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sstr1P30873 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms