Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msr1P30204 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msr1P30204 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Msr1P30204 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msr1P30204 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msr1P30204 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msr1P30204 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msr1P30204 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msr1P30204 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms