Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa2P28309 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa2P28309 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa2P28309 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Defa2P28309 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa2P28309 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa2P28309 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa2P28309 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa2P28309 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa2P28309 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa2P28309 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa2P28309 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms