Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd247P24161 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd247P24161 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd247P24161 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd247P24161 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd247P24161 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd247P24161 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd247P24161 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd247P24161 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms