Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PparaP23204 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PparaP23204 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PparaP23204 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PparaP23204 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PparaP23204 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PparaP23204 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PparaP23204 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PparaP23204 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PparaP23204 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PparaP23204 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PparaP23204 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PparaP23204 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PparaP23204 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PparaP23204 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PparaP23204 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PparaP23204 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PparaP23204 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PparaP23204 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PparaP23204 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PparaP23204 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PparaP23204 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PparaP23204 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PparaP23204 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PparaP23204 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PparaP23204 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PparaP23204 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PparaP23204 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PparaP23204 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PparaP23204 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PparaP23204 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PparaP23204 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PparaP23204 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PparaP23204 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PparaP23204 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PparaP23204 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PparaP23204 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PparaP23204 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PparaP23204 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PparaP23204 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PparaP23204 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PparaP23204 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PparaP23204 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PparaP23204 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PparaP23204 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PparaP23204 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PparaP23204 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PparaP23204 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PparaP23204 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PparaP23204 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PparaP23204 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PparaP23204 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PparaP23204 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PparaP23204 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PparaP23204 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PparaP23204 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PparaP23204 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PparaP23204 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PparaP23204 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PparaP23204 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PparaP23204 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PparaP23204 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PparaP23204 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PparaP23204 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PparaP23204 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PparaP23204 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PparaP23204 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PparaP23204 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PparaP23204 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PparaP23204 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PparaP23204 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PparaP23204 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PparaP23204 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PparaP23204 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PparaP23204 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PparaP23204 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PparaP23204 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PparaP23204 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PparaP23204 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PparaP23204 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PparaP23204 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PparaP23204 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PparaP23204 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PparaP23204 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PparaP23204 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PparaP23204 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PparaP23204 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PparaP23204 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PparaP23204 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PparaP23204 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PparaP23204 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PparaP23204 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PparaP23204 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PparaP23204 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PparaP23204 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PparaP23204 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PparaP23204 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PparaP23204 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms