Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RarbP22605 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RarbP22605 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RarbP22605 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RarbP22605 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RarbP22605 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RarbP22605 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RarbP22605 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RarbP22605 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RarbP22605 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RarbP22605 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RarbP22605 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RarbP22605 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RarbP22605 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RarbP22605 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RarbP22605 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RarbP22605 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RarbP22605 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RarbP22605 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RarbP22605 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RarbP22605 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RarbP22605 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RarbP22605 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RarbP22605 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RarbP22605 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RarbP22605 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RarbP22605 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RarbP22605 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RarbP22605 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RarbP22605 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RarbP22605 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RarbP22605 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RarbP22605 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RarbP22605 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RarbP22605 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RarbP22605 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RarbP22605 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RarbP22605 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RarbP22605 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RarbP22605 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RarbP22605 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RarbP22605 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RarbP22605 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RarbP22605 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RarbP22605 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RarbP22605 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RarbP22605 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RarbP22605 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RarbP22605 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RarbP22605 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RarbP22605 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RarbP22605 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RarbP22605 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RarbP22605 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RarbP22605 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RarbP22605 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RarbP22605 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RarbP22605 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RarbP22605 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RarbP22605 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RarbP22605 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RarbP22605 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RarbP22605 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RarbP22605 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RarbP22605 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RarbP22605 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RarbP22605 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RarbP22605 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RarbP22605 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RarbP22605 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RarbP22605 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RarbP22605 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RarbP22605 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RarbP22605 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RarbP22605 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RarbP22605 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RarbP22605 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RarbP22605 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RarbP22605 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RarbP22605 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RarbP22605 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RarbP22605 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RarbP22605 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RarbP22605 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RarbP22605 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RarbP22605 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RarbP22605 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RarbP22605 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RarbP22605 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RarbP22605 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RarbP22605 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RarbP22605 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RarbP22605 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RarbP22605 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RarbP22605 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RarbP22605 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RarbP22605 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RarbP22605 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RarbP22605 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RarbP22605 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms