Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb9P20615 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb9P20615 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb9P20615 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb9P20615 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb9P20615 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb9P20615 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb9P20615 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb9P20615 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb9P20615 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb9P20615 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms