Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a2P20490 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms