Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Fcer1aP20489 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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