Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PrkcaP20444 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms