Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TP20293 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TP20293 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TP20293 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TP20293 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TP20293 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TP20293 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TP20293 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TP20293 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TP20293 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TP20293 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TP20293 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TP20293 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TP20293 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TP20293 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TP20293 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TP20293 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TP20293 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TP20293 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TP20293 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TP20293 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TP20293 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TP20293 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TP20293 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TP20293 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TP20293 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TP20293 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TP20293 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TP20293 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TP20293 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TP20293 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TP20293 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TP20293 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TP20293 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TP20293 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TP20293 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TP20293 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TP20293 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TP20293 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TP20293 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TP20293 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TP20293 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TP20293 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TP20293 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TP20293 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TP20293 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TP20293 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TP20293 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TP20293 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TP20293 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TP20293 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TP20293 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TP20293 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TP20293 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TP20293 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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TP20293 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TP20293 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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TP20293 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TP20293 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TP20293 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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TP20293 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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TP20293 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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TP20293 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TP20293 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TP20293 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TP20293 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TP20293 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TP20293 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TP20293 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TP20293 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TP20293 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TP20293 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TP20293 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TP20293 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TP20293 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TP20293 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TP20293 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TP20293 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TP20293 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TP20293 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TP20293 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TP20293 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TP20293 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TP20293 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TP20293 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TP20293 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TP20293 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TP20293 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TP20293 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TP20293 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TP20293 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TP20293 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TP20293 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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