Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps6ka3P18654 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka3P18654 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka3P18654 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka3P18654 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka3P18654 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka3P18654 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka3P18654 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka3P18654 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka3P18654 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka3P18654 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka3P18654 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms