Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Dnmt1P13864 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnmt1P13864 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms