Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cntn1P12960 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn1P12960 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn1P12960 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn1P12960 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn1P12960 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cntn1P12960 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn1P12960 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn1P12960 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn1P12960 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn1P12960 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn1P12960 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn1P12960 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn1P12960 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn1P12960 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn1P12960 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn1P12960 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn1P12960 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn1P12960 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn1P12960 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn1P12960 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn1P12960 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn1P12960 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn1P12960 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn1P12960 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn1P12960 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn1P12960 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cntn1P12960 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn1P12960 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn1P12960 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn1P12960 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn1P12960 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cntn1P12960 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn1P12960 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn1P12960 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cntn1P12960 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn1P12960 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn1P12960 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn1P12960 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn1P12960 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cntn1P12960 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn1P12960 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn1P12960 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn1P12960 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn1P12960 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn1P12960 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn1P12960 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn1P12960 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn1P12960 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn1P12960 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn1P12960 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn1P12960 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntn1P12960 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntn1P12960 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntn1P12960 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntn1P12960 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntn1P12960 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntn1P12960 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntn1P12960 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntn1P12960 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntn1P12960 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntn1P12960 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms