Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PolP11369 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PolP11369 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PolP11369 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PolP11369 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PolP11369 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PolP11369 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PolP11369 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PolP11369 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PolP11369 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PolP11369 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PolP11369 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PolP11369 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PolP11369 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PolP11369 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PolP11369 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PolP11369 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PolP11369 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PolP11369 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PolP11369 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PolP11369 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PolP11369 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PolP11369 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PolP11369 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PolP11369 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PolP11369 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PolP11369 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP11369 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP11369 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP11369 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP11369 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP11369 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP11369 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP11369 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP11369 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP11369 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP11369 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP11369 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP11369 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP11369 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP11369 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP11369 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP11369 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP11369 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP11369 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP11369 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP11369 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP11369 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP11369 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP11369 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP11369 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP11369 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP11369 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP11369 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolP11369 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolP11369 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolP11369 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolP11369 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolP11369 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolP11369 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolP11369 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms