Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prf1P10820 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prf1P10820 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prf1P10820 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prf1P10820 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prf1P10820 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prf1P10820 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prf1P10820 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prf1P10820 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prf1P10820 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prf1P10820 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prf1P10820 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prf1P10820 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prf1P10820 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms