Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P10404 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P10404 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P10404 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P10404 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P10404 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P10404 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P10404 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P10404 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P10404 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P10404 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P10404 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P10404 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P10404 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P10404 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P10404 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P10404 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P10404 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P10404 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P10404 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P10404 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P10404 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P10404 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P10404 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P10404 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P10404 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P10404 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P10404 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P10404 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P10404 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P10404 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P10404 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P10404 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P10404 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P10404 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P10404 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P10404 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P10404 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P10404 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P10404 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P10404 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P10404 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P10404 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P10404 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P10404 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P10404 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P10404 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P10404 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
P10404 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
P10404 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P10404 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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