Protein–RNA interactions for Protein: P10078

Zfp28, Zinc finger protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp28P10078 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp28P10078 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms