Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms