Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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H2-Ab1P01921 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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H2-Ab1P01921 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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H2-Ab1P01921 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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H2-Ab1P01921 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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H2-Ab1P01921 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2-Ab1P01921 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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H2-Ab1P01921 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-Ab1P01921 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-Ab1P01921 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-Ab1P01921 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-Ab1P01921 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2-Ab1P01921 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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H2-Ab1P01921 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Ab1P01921 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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H2-Ab1P01921 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Ab1P01921 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Ab1P01921 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Ab1P01921 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Ab1P01921 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Ab1P01921 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Ab1P01921 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Ab1P01921 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Ab1P01921 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Ab1P01921 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Ab1P01921 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Ab1P01921 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Ab1P01921 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Ab1P01921 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Ab1P01921 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Ab1P01921 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Ab1P01921 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Ab1P01921 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Ab1P01921 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
H2-Ab1P01921 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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