Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01679 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01679 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01679 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01679 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01679 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01679 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01679 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01679 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01679 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01679 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01679 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01679 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01679 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01679 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01679 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01679 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01679 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01679 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01679 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01679 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01679 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01679 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01679 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01679 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01679 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01679 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01679 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01679 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01679 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01679 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01679 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01679 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01679 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01679 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01679 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01679 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01679 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01679 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01679 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01679 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01679 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01679 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01679 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01679 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01679 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01679 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01679 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01679 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01679 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01679 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01679 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01679 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01679 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01679 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01679 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01679 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01679 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01679 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01679 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01679 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01679 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01679 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01679 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01679 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01679 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01679 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01679 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01679 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms