Protein–RNA interactions for Protein: P01652

Ig kappa chain V-V region J606, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01652 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01652 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01652 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01652 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01652 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01652 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01652 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01652 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01652 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01652 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01652 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01652 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01652 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01652 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01652 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01652 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01652 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01652 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01652 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01652 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01652 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01652 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01652 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01652 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01652 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01652 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01652 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01652 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01652 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01652 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01652 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01652 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01652 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01652 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01652 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01652 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01652 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01652 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01652 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01652 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01652 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01652 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01652 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01652 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01652 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01652 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01652 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01652 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01652 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01652 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01652 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01652 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01652 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01652 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01652 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01652 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01652 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01652 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01652 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01652 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01652 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01652 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01652 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01652 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01652 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01652 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01652 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01652 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01652 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01652 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01652 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01652 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01652 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01652 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01652 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01652 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01652 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01652 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01652 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01652 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01652 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01652 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01652 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01652 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01652 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01652 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01652 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01652 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01652 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01652 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01652 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01652 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01652 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01652 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01652 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01652 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01652 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01652 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms