Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ShdO88834 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShdO88834 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShdO88834 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShdO88834 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShdO88834 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShdO88834 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShdO88834 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ShdO88834 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShdO88834 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ShdO88834 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShdO88834 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ShdO88834 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ShdO88834 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShdO88834 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShdO88834 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShdO88834 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShdO88834 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShdO88834 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShdO88834 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShdO88834 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShdO88834 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShdO88834 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ShdO88834 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ShdO88834 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ShdO88834 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ShdO88834 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ShdO88834 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ShdO88834 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ShdO88834 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ShdO88834 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ShdO88834 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ShdO88834 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ShdO88834 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ShdO88834 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ShdO88834 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ShdO88834 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ShdO88834 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ShdO88834 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ShdO88834 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ShdO88834 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ShdO88834 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ShdO88834 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ShdO88834 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ShdO88834 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ShdO88834 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ShdO88834 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ShdO88834 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ShdO88834 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ShdO88834 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ShdO88834 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShdO88834 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShdO88834 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShdO88834 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShdO88834 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShdO88834 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShdO88834 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShdO88834 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShdO88834 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShdO88834 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShdO88834 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShdO88834 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShdO88834 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShdO88834 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShdO88834 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShdO88834 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ShdO88834 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms