Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3aO88508 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3aO88508 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms