Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AurkcO88445 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AurkcO88445 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AurkcO88445 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AurkcO88445 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AurkcO88445 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AurkcO88445 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms