Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AvilO88398 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AvilO88398 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AvilO88398 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AvilO88398 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AvilO88398 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AvilO88398 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AvilO88398 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AvilO88398 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AvilO88398 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AvilO88398 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AvilO88398 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AvilO88398 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AvilO88398 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AvilO88398 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AvilO88398 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AvilO88398 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AvilO88398 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AvilO88398 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AvilO88398 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AvilO88398 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AvilO88398 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AvilO88398 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AvilO88398 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AvilO88398 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AvilO88398 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AvilO88398 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AvilO88398 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AvilO88398 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AvilO88398 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AvilO88398 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AvilO88398 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AvilO88398 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AvilO88398 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AvilO88398 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AvilO88398 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AvilO88398 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AvilO88398 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AvilO88398 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AvilO88398 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AvilO88398 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AvilO88398 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AvilO88398 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AvilO88398 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AvilO88398 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AvilO88398 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AvilO88398 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AvilO88398 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AvilO88398 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AvilO88398 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AvilO88398 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AvilO88398 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AvilO88398 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AvilO88398 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AvilO88398 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AvilO88398 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AvilO88398 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AvilO88398 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AvilO88398 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AvilO88398 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AvilO88398 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AvilO88398 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AvilO88398 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AvilO88398 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AvilO88398 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AvilO88398 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AvilO88398 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AvilO88398 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AvilO88398 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AvilO88398 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AvilO88398 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AvilO88398 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AvilO88398 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AvilO88398 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AvilO88398 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AvilO88398 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AvilO88398 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AvilO88398 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AvilO88398 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AvilO88398 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AvilO88398 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AvilO88398 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AvilO88398 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AvilO88398 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AvilO88398 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AvilO88398 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AvilO88398 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AvilO88398 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AvilO88398 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AvilO88398 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AvilO88398 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AvilO88398 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AvilO88398 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AvilO88398 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AvilO88398 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AvilO88398 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AvilO88398 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AvilO88398 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AvilO88398 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AvilO88398 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms