Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid1O70583 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mid1O70583 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mid1O70583 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mid1O70583 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1O70583 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1O70583 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1O70583 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mid1O70583 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms