Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtssO70370 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CtssO70370 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtssO70370 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtssO70370 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtssO70370 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtssO70370 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtssO70370 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtssO70370 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtssO70370 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtssO70370 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtssO70370 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtssO70370 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtssO70370 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CtssO70370 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtssO70370 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtssO70370 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CtssO70370 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CtssO70370 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CtssO70370 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CtssO70370 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtssO70370 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtssO70370 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtssO70370 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CtssO70370 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtssO70370 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtssO70370 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtssO70370 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtssO70370 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtssO70370 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtssO70370 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtssO70370 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtssO70370 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtssO70370 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtssO70370 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CtssO70370 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CtssO70370 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtssO70370 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtssO70370 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CtssO70370 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtssO70370 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CtssO70370 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtssO70370 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtssO70370 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtssO70370 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtssO70370 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtssO70370 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtssO70370 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtssO70370 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtssO70370 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtssO70370 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtssO70370 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtssO70370 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtssO70370 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtssO70370 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtssO70370 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtssO70370 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtssO70370 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtssO70370 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtssO70370 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtssO70370 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtssO70370 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CtssO70370 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtssO70370 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtssO70370 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtssO70370 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtssO70370 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CtssO70370 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtssO70370 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtssO70370 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtssO70370 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CtssO70370 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtssO70370 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtssO70370 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtssO70370 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtssO70370 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtssO70370 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtssO70370 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtssO70370 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtssO70370 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtssO70370 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtssO70370 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtssO70370 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtssO70370 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtssO70370 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtssO70370 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtssO70370 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CtssO70370 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CtssO70370 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtssO70370 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtssO70370 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CtssO70370 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtssO70370 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtssO70370 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtssO70370 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtssO70370 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtssO70370 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtssO70370 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtssO70370 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtssO70370 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms