Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chrna4O70174 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrna4O70174 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms