Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChkbO55229 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChkbO55229 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChkbO55229 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChkbO55229 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChkbO55229 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChkbO55229 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms