Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif6O55135 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif6O55135 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif6O55135 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif6O55135 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif6O55135 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif6O55135 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif6O55135 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif6O55135 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif6O55135 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif6O55135 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif6O55135 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif6O55135 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif6O55135 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eif6O55135 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif6O55135 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif6O55135 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif6O55135 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif6O55135 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif6O55135 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif6O55135 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eif6O55135 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms