Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb2O55029 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb2O55029 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb2O55029 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Copb2O55029 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Copb2O55029 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copb2O55029 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb2O55029 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Copb2O55029 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms