Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SlkO54988 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SlkO54988 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SlkO54988 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SlkO54988 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SlkO54988 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SlkO54988 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SlkO54988 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SlkO54988 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SlkO54988 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SlkO54988 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SlkO54988 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SlkO54988 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlkO54988 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlkO54988 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlkO54988 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlkO54988 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlkO54988 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlkO54988 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlkO54988 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SlkO54988 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlkO54988 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlkO54988 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlkO54988 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlkO54988 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlkO54988 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlkO54988 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlkO54988 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SlkO54988 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlkO54988 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SlkO54988 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SlkO54988 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SlkO54988 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlkO54988 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlkO54988 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlkO54988 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlkO54988 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlkO54988 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlkO54988 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlkO54988 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlkO54988 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlkO54988 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SlkO54988 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SlkO54988 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SlkO54988 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SlkO54988 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SlkO54988 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SlkO54988 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SlkO54988 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SlkO54988 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SlkO54988 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SlkO54988 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SlkO54988 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SlkO54988 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SlkO54988 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SlkO54988 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SlkO54988 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SlkO54988 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SlkO54988 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SlkO54988 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SlkO54988 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SlkO54988 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SlkO54988 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SlkO54988 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SlkO54988 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SlkO54988 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SlkO54988 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SlkO54988 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SlkO54988 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SlkO54988 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SlkO54988 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SlkO54988 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SlkO54988 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SlkO54988 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SlkO54988 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SlkO54988 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SlkO54988 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SlkO54988 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SlkO54988 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SlkO54988 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SlkO54988 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SlkO54988 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SlkO54988 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SlkO54988 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SlkO54988 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SlkO54988 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SlkO54988 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SlkO54988 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SlkO54988 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SlkO54988 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SlkO54988 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SlkO54988 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SlkO54988 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SlkO54988 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SlkO54988 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SlkO54988 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SlkO54988 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SlkO54988 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SlkO54988 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SlkO54988 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms