Protein–RNA interactions for Protein: O54962

Banf1, Barrier-to-autointegration factor, mousemouse

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Banf1O54962 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Banf1O54962 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Banf1O54962 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Banf1O54962 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Banf1O54962 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Banf1O54962 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Banf1O54962 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Banf1O54962 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Banf1O54962 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Banf1O54962 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Banf1O54962 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms