Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp10aO54827 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp10aO54827 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms