Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkaO54804 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkaO54804 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChkaO54804 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms