Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Srpk2O54781 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srpk2O54781 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms