Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Psmb10O35955 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psmb10O35955 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Psmb10O35955 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Psmb10O35955 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms