Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sema6aO35464 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6aO35464 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6aO35464 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6aO35464 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6aO35464 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6aO35464 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6aO35464 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sema6aO35464 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms