Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Polr1aO35134 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr1aO35134 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms