Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gcm2O09102 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gcm2O09102 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms