Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nfil3O08750 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nfil3O08750 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nfil3O08750 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nfil3O08750 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nfil3O08750 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms