Protein–RNA interactions for Protein: O08688

Capn5, Calpain-5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn5O08688 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn5O08688 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn5O08688 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn5O08688 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn5O08688 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn5O08688 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn5O08688 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn5O08688 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn5O08688 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn5O08688 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn5O08688 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn5O08688 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn5O08688 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms