Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MttpO08601 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MttpO08601 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MttpO08601 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MttpO08601 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MttpO08601 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MttpO08601 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MttpO08601 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MttpO08601 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MttpO08601 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MttpO08601 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MttpO08601 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MttpO08601 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MttpO08601 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MttpO08601 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MttpO08601 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MttpO08601 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MttpO08601 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MttpO08601 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MttpO08601 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MttpO08601 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MttpO08601 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MttpO08601 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MttpO08601 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MttpO08601 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MttpO08601 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MttpO08601 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MttpO08601 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MttpO08601 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MttpO08601 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MttpO08601 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MttpO08601 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MttpO08601 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MttpO08601 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MttpO08601 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MttpO08601 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MttpO08601 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MttpO08601 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MttpO08601 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MttpO08601 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MttpO08601 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MttpO08601 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MttpO08601 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MttpO08601 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MttpO08601 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MttpO08601 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MttpO08601 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MttpO08601 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MttpO08601 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MttpO08601 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MttpO08601 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MttpO08601 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MttpO08601 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MttpO08601 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MttpO08601 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MttpO08601 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MttpO08601 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MttpO08601 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MttpO08601 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MttpO08601 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MttpO08601 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MttpO08601 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MttpO08601 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MttpO08601 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MttpO08601 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MttpO08601 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MttpO08601 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MttpO08601 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MttpO08601 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MttpO08601 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MttpO08601 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MttpO08601 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MttpO08601 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MttpO08601 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MttpO08601 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MttpO08601 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MttpO08601 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MttpO08601 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MttpO08601 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MttpO08601 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MttpO08601 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MttpO08601 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MttpO08601 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MttpO08601 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MttpO08601 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MttpO08601 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MttpO08601 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MttpO08601 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MttpO08601 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MttpO08601 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MttpO08601 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MttpO08601 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MttpO08601 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MttpO08601 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MttpO08601 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms