Protein–RNA interactions for Protein: K7N721

Gm3248, Predicted gene 3248, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3248K7N721 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3248K7N721 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3248K7N721 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms