Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20873J3QMQ9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20873J3QMQ9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms