Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3727J3QM54 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm3727J3QM54 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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